Das Interior des Fabia Combi hat sich deutlich verändert. Das Armaturenbrett hält die ergonomischen Grundprinzipien konsequent ein. Das heisst, der Fahrerplatz ist optimal organisiert und hält ein Maximum an Komfort, Sicherheit und Bequemlichkeit für den Fahrer bereit.
Der hintere Teil des Fahrzeuges beinhaltet genügend Platz für Passagiere auf den Rücksitzen und bietet viel Stauraum mit Ablagefächern. Für das Interior werden qualitativ hoch stehende Materialien verwendet.
Die Aufteilung der Ablagefächer auf der Passagierseite sind in verschiedenen Ausführungen, entweder offen oder verschliessbar, je nach Ausstattungsvariante erhältlich. Die kleine verschliessbare Box kann in den mit Klimaanlagen ausgestatteten Fahrzeugen als kleiner Kühlschrank benutzt werden.