Début décembre 1895, le mécanicien Václav Laurin et le libraire Václav Klement, cyclistes passionnés, s'inspirent de leurs propres dessins pour démarrer la fabrication de bicyclettes. Dans l'atmosphère nationaliste du 19e siècle, ils l'appelèrent Slavia. En 1899, Laurin & Klement était le plus gros constructeur de bicyclettes du pays et l'entreprise en plein essor commença la même année à fabriquer des motos qui furent exportées vers l'Angleterre. Elles connurent un rapide succès et remportèrent même quelques belles victoires lors de manifestations sportives.

1905-1918
Après les premiers prototypes du tournant du siècle, on commença à fabriquer en 1905 des automobiles à Boleslav. La première voiture de L&K, la voiturette A, fut le début d'une véritable offensive de production. En 1907, on proposait déjà neuf modèles différents, de la petite voiture particulière à moteur V 2 cylindres jusqu'à des transporteurs et des omnibus, en passant par une voiture de course 4 cylindres. À la même époque, on  développa aussi le premier 8 cylindres de série de 4,9 l de cylindrée. Les fondateurs de l'entreprise transformèrent l'entreprise familiale en société par actions. La SA devint le plus gros constructeur automobile de l'empire austro-hongrois, les véhicules furent exportés dans le monde entier. Le constructeur de Mladá Boleslav organisa des salons automobiles dans les principaux salons automobiles de Leipzig, Paris, Berlin et Saint-Pétersbourg. Laurin & Klement utilisèrent par ailleurs le sport automobile pour accroître la notoriété de leur marque. Le pilote d'usine, Otto Hieronimus, remporta un succès mondial par catégorie sur le premier circuit permanent de Brooklands (GB), connut des succès dans la course de Semmering (A) et la course de Saint-Pétersbourg – Moscou: des bases essentielles pour accroître la renommée internationale.
1925-1938
La production s'était étendue pendant les années 20 à de nombreux types de voitures particulières et poids lourds, autobus mais aussi moteurs d'avion et machines agricoles. L'entreprise fusionna en 1925 avec les usines Škoda de Pilsen pour renforcer sa position sur le marché. Des véhicules de 4, 6 et 8 cylindres virent le jour, sous le nouveau nom conjoint d'entreprise Škoda. Dès 1930, la production automobile fut mise à part, dans le cadre du consortium Škoda, comme société par actions de l'industrie automobile (ASAP). En 1933, la mise au point du cadre central pour le standard 420 constitua une grande étape vers son développement de la construction de châssis. Les ingénieurs créèrent à Mladá Boleslav une base importante pour un poids de véhicule réduit et une sobriété des nouveaux modèles.
1934: l'essor par de nouveaux modèles
Avec les types de véhicules Popular, Rapid, Favorit et Superb, Škoda créa à partir de 1934 une nouvelle génération de véhicules qui connut le succès: ils étaient équipés du châssis mono-poutre moderne, de moteurs OHV et d'une technique aboutie. Avec l'arrivée de la Popular sur le marché, une voiture compacte économique, les ventes s'envolèrent. Avec la voiture du peuple tchèque, le constructeur traditionnel dépassa pour la première fois la limite de 5000 voitures d'une gamme. Cette évolution fut interrompue par la deuxième guerre mondiale qui anéantit le programme civil de production. Parallèlement à la fabrication de différents armements, ce furent essentiellement différents types de wagons à benne, voitures tout-terrain avec quatre roues motrices et les lourds tracteurs chenillés RSO qui furent montés sous la pression de l'occupation allemande.
1939
L'occupation allemande de 1939 à 1945 intégra Škoda complètement dans la structure de l'empire allemand, ce qui occasionna un assez grand bouleversement dans l'histoire de l'entreprise. Le programme civil fut considérablement restreint et Škoda ne produisit plus que l'indispensable. Lors des élections qui suivirent la deuxième guerre mondiale, les communistes prirent le pouvoir. Les nouveaux potentats marquèrent aussi l'économie de leur empreinte idéologique. La même année, l'entreprise de Mladá Boleslav fut nationalisée sous le nom de AZNP Škoda (entreprise nationalisée).
1948
Du fait des processus traditionnels de production et des succès remportés par le passé, l'économie tchèque put conserver un standard international relativement bon pour plusieurs décennies pendant l'époque post-socialiste, en dépit des modifications imposées par l'économie planifiée et de ses tentatives pour atteindre une croissance extrêmement rapide. Avec le type 1200, Škoda présenta dès 1952 la première voiture particulière avec nouvelle carrosserie ponton : une caractéristique de design qui allait se poursuivre jusqu'à la fin des années 50 dans toute l'Europe. Avec les modèles Octavia, version voiture particulière et Combi, la variante cabriolet Felicia et ses devancières, on eut, à partir de 1955, la Škoda la plus vendue jusqu'ici du programme. Avec l'Octavia TS, dont le moteur sportif avec carburateur double corps mobilisait, dès la série, 55 ch, de nombreux succès purent être remportés pendant des rallyes. La sixième place au rallye Monte-Carlo de 1961 par le jeune finnois Esko Keinänen fut particulièrement remarquable. L'Octavia présentée en 1959 resta au programme jusqu'en 1964 en version berline et même jusqu'en 1970 en version combi.
S'inspirant de la tendance de l'époque, Škoda présenta la berline à moteur arrière 1000 MB. Le constructeur tchèque disposait ainsi pour la première fois d'un modèle avec carrosserie auto porteuse. Le moteur d'1 l était le moteur le plus moderne de sa catégorie avec un bloc moteur construit selon le procédé breveté de moulage aluminium sous pression. En 1970 fut présenté, le 110R, un moteur sportif qui, comme le Felicia, était construit dans les usines de Kvasiny. Les ingénieurs le transformèrent en modèle de pointe, le 130 RS, qui permit aux coureurs d'usine et les coureurs privés de remporter de nombreuses victoires. Une victoire dans sa classe saluée lors du rallye Monte-Carlo de 1977 et même le titre par marque lors du championnat d'Europe de voitures de tourisme en 1981 purent être remportés. Comme le moteur de base moderne d'1 l de cylindrée était déjà porteur de gènes sportifs, il put convaincre aussi en moteur de voiture de course. En 1968, le coureur d'usine Miroslav Fousek gagna le championnat de l'Europe de l'Est de formule 3.

L'introduction de la gamme Favorit en 1987 fut une révolution dans l'histoire du modèle. Le passage en temps record au concept moderne de véhicule avec moteur à l'avant, traction avant et carrosserie compacte avec grand hayon fut une véritable réussite. La stagnation durable de l'économie s'installa à la fin des années 70 et toucha aussi le constructeur automobile domicilié à Mladá Boleslav, malgré la position de leader de l'entreprise sur le marché de l'Europe de l'Est. La production ne repartit qu'avec la construction de la gamme Škoda Favorit en 1987.
1991
A Mladá Boleslav, Škoda se mit en quête après le tournant politique de 1989 et dans de nouvelles conditions économiques, d'un partenaire étranger puissant afin de sécuriser durablement l'entreprise et de la rendre à nouveau concurrentielle à l'échelon international. En décembre 1990, le gouvernement tchèque s'est décidé pour une coopération avec le groupe allemand Volkswagen. Le tandem Škoda-Volkswagen a pris ses fonctions le 16 avril 1991 sous le nom de Škoda automobilová a.s. et a été accueilli au sein du groupe Volkswagen comme quatrième marque, aux côtés de VW, Audi et SEAT. En 1992, AMAG Automobil- und Motoren AG a pu être intéressé en tant qu'importateur suisse à la marque Škoda. Portées par la coopération internationale et la nouvelle pensée économique, de vastes mesures de modernisation furent introduites par la suite dans le management, marketing, le développement de produits et les déroulements de fabrication. C'est ainsi que la gamme Favorit/Forman fut remplacée en 1994 par la Škoda Felicia qui correspondait en termes de qualité et de styling aux critères internationaux. Le 14 février 1995 fut posée la première pierre de l'usine de production du nouveau futur modèle de catégorie moyenne l'Octavia à Mladá Boleslav.
On put fêter fin avril 1996 à Mladá Boleslav la production du millionième véhicule Škoda depuis les cinq ans d'existence de l'entreprise communautaire. Avec la nouvelle Škoda Octavia, ce fut la création à la même période d'une deuxième ligne de modèle et on construisit l'usine de montage conçue selon les points de vue les plus modernes (modulare Fabrik). En 1998, Škoda produisit pour la première fois plus de 400’000 véhicules par an qui furent exportés dans 70 pays du monde. Le célèbre modèle Octavia qui fut complété en 1998 par une version combi et en 1999 par une version 4x4 y contribua tout particulièrement. Škoda investit dans un nouveau centre de recherche-développement et construisit un dépôt moderne de pièces de rechange. D'autres investissements dans une usine de moteurs et un centre client suivirent. Avec la nouvelle Fabia, la marque Škoda fit à nouveau la démonstration en 2000 qu'elle construit des véhicules de qualité supérieure, d'une technicité exigeante, dans un design attractif. La Fabia fut rapidement récompensée par le volant d'or.
2008
2008: trois gammes, une nouvelle Superb et beaucoup de récompenses
En mars 2008 eut lieu la première de la nouvelle Škoda Superb au salon de l'automobile de Genève. Elle écrivait ainsi un nouveau chapitre de l'histoire de la tradition de cette gamme introduite en 1934 par le constructeur tchèque. La nouvelle Škoda Fabia présentée l'année précédente s'inspire des succès de sa devancière. Elle gagne le volant d'or et le choix des lecteurs de auto, motor et sport, plusieurs autres récompenses et tests comparatifs dans des magazines automobiles importants. La quatrième gamme du prodige d'espace, le Škoda Roomster, enrichit en outre depuis 2006 la palette de modèles. L'offre est complétée par le véhicule utilitaire léger Praktik.
2009
2009: la cinquième gamme
Le nouveau Škoda Yeti a fêté sa première mondiale en mars 2009 au salon de l'automobile de Genève. La cinquième gamme de Škoda fait ainsi son entrée sur le marché. Un SUV compact avec la ligne typique de Škoda . Fin septembre, elle est prête pour un test de conduite chez les partenaires Škoda. La marque, qui compte parmi les plus anciens constructeurs automobiles encore en activité, est représentée dans 100 pays dans le monde. Škoda Auto emploie dans le monde environ 29’000 collaborateurs, entretient des usines de production en Tchéquie, Ukraine, au Kazakhstan, en Russie, en Bosnie-Herzégovine, en Inde et en Chine. Les chiffres de vente ont doublé en Suisse depuis 2005 et Škoda revendique une part de marché de 4 %. Le marché automobile est très convoité et Škoda jouit d'une faveur croissante grâce à des produits de grande qualité.